З метою підвищення рівня контролю під час розміщення товарів на склади тимчасового зберігання та митні ліцензійні склади відкритого типу, а також фіксації переміщення товарів територією вантажних митних комплексів в Миколаївській митниці створено та введено в дію Моніторинговий центр. Про це повідомляє сайт Миколаївської митниці.

Контроль ведеться за допомогою систем відеоспостереження за в'їздом та виїздом до(з) місця прибуття, перебуванням товарів на складах та засобами автоматичного зчитування реєстраційних номернів знаків.